Inca Educa biedt een unieke mix van vakscholing en persoonlijke vorming aan, die onderscheidend is ten aanzien van andere scholen. Het onderwijsconcept gaat uit van competentiegericht leren (kennis, houding en vaardigheden) en van een integrale aanpak (vakscholing, persoonlijke ontwikkeling en burgerschapsvorming). Per 1-1-2011 is Inca Educa door het Ministerie van Onderwijs erkend als CETPRO (Centro de Educacion Tecnico Productivo; educatief centrum voor vaktechnisch onderwijs). Volgens de eisen van de onderwijswetgeving biedt een CETPRO een cursus van een jaar aan, ingedeeld in 4 modules, die allen apart gevolgd kunnen worden. Na elke module krijgen de leerlingen een certificaat en na afronding van 4 modules van samen 1000 studie-uren krijgen ze een diploma.
Aan sommige cursussen is een stage verbonden, zodat de leerlingen praktijkervaring opdoen in het vak waar ze voor hebben geleerd.

Inca Educa zet zich er voor in dat cursisten die na hun opleiding een eigen bedrijf willen beginnen daarbij een steuntje in de rug krijgen door middel van een workshop ondernemen. Door de stages en werkervaringsplaatsen kunnen leerlingen na afronding van hun studie makkelijker werk vinden. Inca Educa helpt de leerlingen naar het zoeken van werk. Sommige leerlingen blijven werken in het bedrijf waar ze stage hebben gelopen. Inca Educa heeft een crèche voor kinderen van de deelnemers en een studiebibliotheek met internetvoorziening